但是個人投資者可以通過其他變相的途徑參與新三板的交易，比如借助專門的私募或者PE通道間接參與，也可以通過創建資產管理公司進行交易，只是如果通過這樣的方式進行交易，投資者的身份就從個人轉變為法人了，投資者需要交納一定的資本利得稅。
機構投資者開戶開戶費為100元人民幣，開戶的時候需要帶上企業法人營業執照或注冊登記證書、法定代表人證明書、法定代表人身份證、法定代表人授權委托書、經辦人身份證等證件到任意一家主辦券商屬下營業網點辦理。與股票開戶不同，新三板的投資者需要到建設銀行開立結算賬戶，用于股份報價轉讓的資金結算。如果已經具備深交所A股交易資格，就不用重復開戶了。
交易的時候投資者可以通過委托證券公司的報價系統進行交易，也可以不通過券商自行尋找買賣對手。交易達成之后，需要向證券公司提供買賣確定性委托，需注明成交約定號、股份名稱和代碼、賬戶、買賣類別、價格、數量、擬成交對手方席位號等內容。
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